共分散
■共分散とは
・ふたつの事柄に関係があるかどうかを知るために求める値
・つまり、独立なら0となる。
・例はこちらがわかりやすい
■相関係数
・似た概念で、相関係数がある。
・これは-1〜1の値を取る。
・共分散の値を、各変数の標準偏差の積で割ったもの。
■分散共分散行列Variance-covariance matrix
・Rを使って計算
nsample<-100 nmarker<-10 d<-runif(nsample*nmarker) d<-d-0.5 d<-sign(d) # sign関数は、要素が正なら1負なら-1、零なら0と変換する関数 m<-matrix(d,ncol=nsample) c<-cov(t(m)) #t()は転置行列 、cov()は不偏分散共分散行列を求める関数 af<-apply(m,1,mean) # mの行(1)に対して、meanという関数を適応する 2なら列に対して適応
こちら参照
